本属细菌包括肠道沙门菌(S.enterica)(又称猪霍乱沙门菌，S.choleraesuis)和邦戈尔沙门菌(S.bongori)两个种，前者又分为6个亚种，包括2500多个具有运动性的非宿主专一性的副伤寒血清型。

沙门菌具有O(菌体)、H(鞭毛)、K(荚膜，又称Vi)和菌毛四种抗原，其中前两种是主要抗原。

沙门菌属依据不同的O抗原、K抗原和H抗原分为不同的血清型。

迄今，沙门菌共有51个O群，58种O抗原，63种H抗原，组成了2500种以上的血清型，除了不到10个罕见的血清型属于邦戈尔沙门菌外，其余血清型都属于肠道沙门菌。

分类研究表明，沙门菌属的细菌依据其对宿主的感染范围，可分为宿主适应性血清型和非宿主适应性血清型两大类。

前者只对其适应的宿主有致病性，包括伤寒沙门菌、副伤寒沙门菌(A型和C型)、马流产沙门菌、羊流产沙门菌、鸡伤寒沙门菌、鸡白痢沙门菌；后者则对多种宿主有致病性，包括鼠伤寒沙门菌、鸭沙门菌、德尔卑沙门菌、肠炎沙门菌、纽波特沙门菌、田纳西沙门菌等。

至于猪霍乱沙门菌和都柏林沙门菌，原来认为分别对猪和牛有宿主适应性，近来发现它们对其他宿主也能致病。

沙门菌的血清型虽然很多，但常见的危害人和动物的非宿主适应血清型只有20多种，加上宿主适应血清型，也不过仅30余种。

本属细菌对干燥、腐败、日光等因素具有一定的抵抗力，在外界条件下可以生存数周或数月。

对化学消毒剂的抵抗力不强，一般常用消毒剂和消毒方法均能达到消毒目的。

通常情况下，对多种抗菌药物敏感。

但由于长期滥用抗生素，对常用抗生素耐药现象普遍，不仅影响该病防控效果，而且亦成为公共卫生关注的问题。