解决了巨兽后，主角团继续深入洞府。他们在洞府的深处，发现了一块散发着强烈黑暗气息的黑色水晶。阿强说道：“看来这就是黑暗能量的源头了。”正当他们准备研究如何处理这块水晶时，神秘组织突然出现。

神秘组织首领看着那块黑色水晶，眼中闪过一丝贪婪，他说道：“这块水晶蕴含着强大的力量，应该由我们神秘组织来处理。”阿强皱眉，说道：“是我们先发现的，而且这黑暗能量对世间危害极大，必须妥善处理。”双方剑拔弩张，气氛瞬间紧张起来。

就在这时，黑色水晶突然剧烈震动，黑暗能量以它为中心，疯狂地向外扩散。主角团和神秘组织都受到了黑暗能量的冲击，他们不得不暂时放下分歧，共同抵御黑暗能量。

在抵御黑暗能量的过程中，瑶儿突然想到了一个办法。她说道：“我们可以利用各自的力量，将黑暗能量引入一个特定的法阵中，然后用净化之力将其彻底消除。”阿强点头，说道：“这是个办法，但需要我们密切配合。”神秘组织首领也无奈地说道：“事到如今，也只能如此了。”

于是，主角团和神秘组织开始合作。他们按照瑶儿所说，迅速布置法阵。阿强、云逸和神秘组织的高手们负责引导黑暗能量，使其朝着法阵的方向汇聚。瑶儿和灵儿则站在法阵中央，准备施展净化之力。

当黑暗能量全部汇聚到法阵中后，瑶儿和灵儿同时发动法术。她们手中的法杖光芒大盛，一道耀眼的净化之光从法阵中升起，与黑暗能量激烈地对抗着。黑暗能量不甘示弱，不断地挣扎，试图冲破净化之光的束缚。

在这关键时刻，主角团和神秘组织的成员们都全力以赴。他们不断地注入灵力，增强净化之光的力量。经过一番艰苦的努力，净化之光终于逐渐占据了上风，黑暗能量被一点点地消除。

随着最后一丝黑暗能量的消散，青城山的黑暗危机终于暂时解除。山林中的树木开始重新焕发生机，枯黄的树叶渐渐变绿，河流也恢复了清澈，那些受黑暗能量侵蚀的生物也恢复了正常。

主角团和神秘组织看着恢复生机的青城山，心中都松了一口气。虽然这次危机暂时解决，但他们都明白，未来还会有更多的挑战等待着他们。而关于如何彻底消除古神残留的黑暗能量，以及黑暗余波是否还会引发其他更严重的后果，依然是笼罩在他们心头的重重迷雾。但此刻，他们已经做好了准备，携手共同面对未来的一切未知。