自然疫源性疾病具有明显的地区性和季节性，并受人类活动的显着影响。

当人类随着开荒、采伐、开矿、修路、野外作业等闯进这些生态系统时(如原始森林、沙漠、草原、深山等荒野地区)，可能感染自然疫源性疾病并将其带出，而且会破坏特定生态系统的相对平衡，导致宿主和传播媒介数量下降甚至完全消灭，病原体也就随之消失。

例如森林被破坏后，植被、土壤、气候等一系列自然因素都随之发生变化，因而导致森林脑炎病毒的宿主啮齿动物和传播媒介蜱类消失，森林脑炎也就不复存在了。

自然疫源性实际上也是一种生态学现象，自然疫源地中的病原体、传播媒介和宿主都是特定生物系统中的成员。

以动物为主的和人与动物并重的人兽共患病均属于自然疫源性疾病，因为这些传染病离开人类的参与仍然可以在自然界循环传播、延续存在。

其中以动物为主的人兽共患病称为动物源性人兽共患病，这些传染病不是人类本身固有的，而是来源于自然界动物。

据统计，目前已知的自然疫源性人兽共患传染病有120余种，其中

病毒性的约60种，如流行性出血热、森林脑炎、狂犬病、流行性乙型脑炎、黄热病等；

细菌性的(含衣原体、螺旋体、立克次体等)约50多种，如鹦鹉热、Q热、鼠型斑疹伤寒、蜱传斑疹伤寒、鼠疫、布鲁菌病、炭疽、蜱传回归热、钩端螺旋体病等；

真菌性的有4种，如隐球菌病、放线菌病、皮肤真菌病等。